Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN6Q9Y6Q1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms