Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms