Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIC4Q9Y696 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC4Q9Y696 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC4Q9Y696 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms