Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPG1Q9Y678 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms