Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE2Q9Y5Z0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BACE2Q9Y5Z0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE2Q9Y5Z0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms