Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSC4Q9Y5U2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSSC4Q9Y5U2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms