Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP16Q9Y5T5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms