Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCYT1BQ9Y5K3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCYT1BQ9Y5K3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCYT1BQ9Y5K3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms