Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3HQ9Y535 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3HQ9Y535 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms