Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIT1Q9Y3P8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIT1Q9Y3P8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIT1Q9Y3P8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms