Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC9Q9Y397 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC9Q9Y397 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZDHHC9Q9Y397 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms