Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX24Q9Y343 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms