Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms