Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP20Q9Y2K6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms