Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3LQ9Y262 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms