Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GINS2Q9Y248 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GINS2Q9Y248 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GINS2Q9Y248 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GINS2Q9Y248 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms