Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC2Q9Y235 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms