Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMC3Q9UQE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMC3Q9UQE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms