Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN8AQ9UQD0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms