Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIAA1024Q9UPX6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIAA1024Q9UPX6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIAA1024Q9UPX6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIAA1024Q9UPX6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms