Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF9BQ9UPX0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms