Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms