Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP1Q9UPQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP1Q9UPQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms