Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP4E1Q9UPM8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4E1Q9UPM8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms