Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSR3Q9UNL2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SSR3Q9UNL2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms