Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHTF1Q9UMS5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHTF1Q9UMS5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms