Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRPF19Q9UMS4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms