Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MED23Q9ULK4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MED23Q9ULK4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms