Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLBQ9ULI2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms