Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN2Q9UL51 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN2Q9UL51 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN2Q9UL51 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms