Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RCAN3Q9UKA8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RCAN3Q9UKA8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RCAN3Q9UKA8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RCAN3Q9UKA8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms