Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LAMP5Q9UJQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMP5Q9UJQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms