Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CNOT7Q9UIV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNOT7Q9UIV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms