Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms