Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX20Q9UHI6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms