Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3BQ9UH17 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3BQ9UH17 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms