Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms