Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
IFT172Q9UG01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
IFT172Q9UG01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
IFT172Q9UG01 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms