Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJB4Q9UDY4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJB4Q9UDY4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms