Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS7AQ9UBW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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