Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPASTQ9UBP0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms