Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF10DQ9UBN6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms