Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MYO1AQ9UBC5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1AQ9UBC5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms