Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-18Q9QC07 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms