Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRBP1Q9P2E9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms