Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT4Q9P109 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT4Q9P109 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms