Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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SH3BP4Q9P0V3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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