Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKIPSDQ9NZQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms