Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKD2L2Q9NZM6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKD2L2Q9NZM6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms