Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOP53Q9NZM5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP53Q9NZM5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP53Q9NZM5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms