Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 CD99-201ENST00000381177 756 ntTSL 210.08□□□□□ -0.82e-11■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TMEM110-205ENST00000482155 525 ntTSL 416.08■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TMEM110-MUSTN1-203ENST00000514466 755 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 PIAS4-202ENST00000593518 555 ntTSL 412.84□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TMEM110-MUSTN1-201ENST00000495552 5280 ntTSL 211.06□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 PIAS4-204ENST00000599999 581 ntTSL 310.88□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 PIAS4-205ENST00000600566 624 ntTSL 210.88□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.862e-10■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.47e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 221.3■■□□□ 19e-7■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 30
FAM120AQ9NZB2 RGS12-210ENST00000506631 1530 ntTSL 1 (best)25.57■■□□□ 1.689e-7■■■■■ 30
FAM120AQ9NZB2 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 30
FAM120AQ9NZB2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 30
FAM120AQ9NZB2 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)20.44■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 30
FAM120AQ9NZB2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 ARPC5-204ENST00000462965 2455 ntTSL 24.35□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 215.82■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 422.24■■□□□ 1.152e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 320.55■□□□□ 0.882e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 519.74■□□□□ 0.752e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.732e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 518.46■□□□□ 0.552e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 217.51■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 516.58■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)13.83□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.32e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-10■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 524.33■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 319.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 318.53■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 TRIM13-203ENST00000378183 1251 ntTSL 221.89■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 TRIM13-208ENST00000478111 478 ntTSL 218.43■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 TRIM13-205ENST00000442421 692 ntTSL 514.27□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 TRIM13-207ENST00000474805 403 ntTSL 513.94□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 PRPS1-201ENST00000372418 942 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.534e-13■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 29.9
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 214.77□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.62e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 219.69■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-221ENST00000567999 578 ntTSL 1 (best)23.31■■□□□ 1.322e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-224ENST00000569061 651 ntTSL 519.66■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-204ENST00000561784 612 ntTSL 418.95■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-217ENST00000566820 549 ntTSL 417.44■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-203ENST00000561741 580 ntTSL 417.28■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-209ENST00000562986 468 ntTSL 417.17■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-208ENST00000562578 573 ntTSL 417.06■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-216ENST00000566079 516 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-222ENST00000568096 543 ntTSL 516.95■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-220ENST00000567884 572 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-226ENST00000569803 539 ntTSL 515.49■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-205ENST00000561959 558 ntTSL 514.92□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-218ENST00000567243 550 ntTSL 514.38□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 227.35■■□□□ 1.971e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.781e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 PRKD2-209ENST00000597589 1682 ntTSL 525.56■■□□□ 1.681e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.611e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 PRKD2-212ENST00000599019 1703 ntTSL 522.1■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 KLK7-204ENST00000595638 577 ntTSL 419.88■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 PCBP4-209ENST00000471358 559 ntTSL 218.79■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 KLK7-201ENST00000304045 1975 ntTSL 218.76■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 DCAF15-206ENST00000591802 506 ntTSL 318.57■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 29.8
FAM120AQ9NZB2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 29.8
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 193 ms